Yoshis gamla, goda Flutter Jump, Ground Pound och äggkastning återvänder, tillsammans med nya förmågor och utmaningar som utnyttjar Nintendo 3DS funktioner. Du kan använda massiva ägg som kallas Mega-Eggs för att förstöra block och rör och avslöja hemligheter som mynt och dolda nycklar. Ju fler saker du förstör, desto högre går Mega-Egg-mätaren och ger dig extra liv!