Rutger Lagercrantz, född 14 november 1917 i Oscars församling i Stockholm, död 23 november 2003 i Farsta församling i Stockholm, var en svensk barnläkare.

Lagercrantz blev legitimerad läkare 1944, medicine doktor 1956 och docent i pediatrik vid Karolinska Institutet 1957. Han blev biträdande överläkare 1959 och senare överläkare. Han fick professors namn 1982.

Hans doktorsavhandling handlade om skyddseffekten av vaccinering mot tuberkulos. I samarbete med professor Sven Gard införde han vaccinering mot polio i Sverige. Hans 30-åriga forskning rörande tarmsjukdomen ulcerös kolit bidrog till att man till slut fick en förklaring till sjukdomens uppkomst och kunde få fram effektiva behandlingsmetoder.