Rune Factory 5 är ett actionrollspel med inslag av livssimulering. Spelet utspelar sig i Rigbarth, en mystisk stad där gränsen mellan mänsklighet och natur är suddig. Spelaren tar rollen som en ny invånare i Rigbarth och måste hjälpa till att återställa balansen mellan de två världarna. Spelet innehåller en mängd olika aktiviteter, inklusive odling, fiske, strid och att bygga relationer med andra invånare.